La Aeromicología es una ciencia multidisciplinaria que estudia el origen, liberación, transporte, dispersión y deposición de los hongos del aire. También estudia la diversidad, concentración y distribución de estos aerosoles que alcanzan elevadas concentraciones en determinadas épocas del año. Las características climatológicas de La Habana favorecen la presencia en el aire de hongos con potencialidades alergénicas. El objetivo de este trabajo fue determinar la diversidad y variación temporal fúngica diurna de la atmósfera de La Habana durante el año 2013. Se realizaron 29 muestreos (Enero a Diciembre de 2013) a la hora 11 mediante un método volumétrico viable, utilizando un biocolector de rendija (Aeroscopio Chirana). A partir de los aislados se caracterizaron los géneros fúngicos y de los más frecuentes se determinó la variación temporal de la concentración. Se identificaron 233 aislados correspondientes a nueve géneros fúngicos, de los cuales un gran número son potencialmente alergénicos, lo cual evidencia una amplia diversidad diurna en la atmósfera de La Habana. Los géneros más frecuentes y abundantes fueron Cladosporium, Aspergillus y Penicillium, prevaleciendo las altas concentraciones de Cladosporium. Estos géneros son reportados como causantes de alergias Cuba y en varias regiones del mundo debido a que pueden penetrar al tracto respiratorio por las dimensiones de sus propágulos.